故事紧接上一季结尾，Kiera阻止了Liber8组织发动的恐怖袭击，但事情却远不止这么简单。当本季开始之时，市长被大胆的刺客刺杀，已经消失了一段时间的Kiera不得不再次出现，与Carlos联手调查这起案件。与此同时，Kiera尝试与Alec重新取得联系并缓解他们之间的紧张关系，但是Alec在读过未来自己所留的信息之后已经完全变了一个人。
俊浩入伍后意外成为追缉逃兵的一员，他将与浩烈搭档行动，共同面对那些逃兵背后的隐情和无法逃避的现实。
百万富翁的继承人Bank正被一个想杀他的人追赶。他身受重伤，因此藏在Norah集团。领导的女儿Baifern照顾他，很快他们就对彼此产生了感情，同时他在调查谁试图杀死他。Bank决定回到曼谷。他向Baifern保证，一旦完成就会回到她身边。但发生了一些事情，将他们分开了。
位于热带海域的一座无名小岛，蔚蓝大海与金色沙滩接壤之初，飞机破碎的残骸伴随着遇难乘客的恸哭哀号，揭开了一个神秘故事的序幕。2004年，815航班在前往目的地的途中突遭变故，坠毁在这座小岛，机上仅有杰克·谢帕德（马修·福克斯 Matthew Fox 饰）、凯特·奥斯汀（伊万杰琳·莉莉 Nicole Evangeline Lilly 饰）等48人侥幸逃生。最初的惊恐过后，不同年龄、职业、国别、民族、背景的一群人，在这个与世隔绝的逼仄且食物紧缺的空间内不可避免发生冲突与碰撞，与此同时，小岛上似乎还隐藏着某种未知且极具威胁的生物，而他们的一举一动又仿佛被一双双充满智慧但又神秘莫测的眼睛所监视。 不可预测的未来，接二连三的谜团，以及仿佛永远无法到来的救援队，让幸存者们不知所措……
